La Valutazione della Qualità della Ricerca (VQR) è il tentativo più sistematico finora effettuato di quantificare l’impegno e i risultati del sistema universitario e della ricerca italiana. A fronte di risultati di grande interesse (soprattutto statistico e quantitativo) occorre tuttavia rilevare alcuni limiti metodologici che hanno reso difficile una corretta interpretazione del significato qualitativo degli indicatori, mentre d’altro canto l’eccessiva (e spesso ingiustificata) enfasi su alcuni parametri di natura bibliometrica rischia di condizionare impropriamente le scelte scientifiche e culturali di un’intera generazione di studiosi, anche per la correlazione che si è voluta immediatamente stabilire tra i risultati della VQR e i finanziamenti al sistema universitario. Si propone una discussione approfondita di queste criticità, anche al fine di individuare meccanismi correttivi volti ad eliminare gli effetti potenzialmente distorsivi di un utilizzo acritico degli esiti della valutazione. 
Parole chiave: Università, Valutazione, VQR, Bibliometria, Sampling Bias.